合作企業是一種企業組織形式，指兩個或多箇企業、公司或其他經濟組織按照平等互利的原則，在中國境內共同投資舉辦的契約式經營的企業。
合作企業通常遵循契約式合營方式，合作各方共同出資、經營，並共享收益和分擔風險，合作企業可以組成具有法人資格的實體，如有限責任公司，也可以是不具有法人資格的合夥形式。合作企業在中國法律的框架下，經政府批准，允許外國合作者先行回收投資，合作企業可以有不同的經營模式和法律形式，常見的包括合資企業和合作企業，兩者的主要區別在於合營方式，合資企業通常採用股權式合營方式，而合作企業則採用契約式合營方式。