基因文庫是一種科學技術工具，用於存儲和研究生物體的基因。
基因文庫主要分為兩類，基因組文庫和部分基因文庫（如cDNA文庫）。基因組文庫包含了某種生物的所有基因，而部分基因文庫，如cDNA文庫，只包含某種生物的一部分基因，通常是由mRNA反轉錄得到的cDNA。
基因文庫的構建過程包括將生物體的DNA酶切成小片段，然後將這些片段連線到載體上並導入宿主細胞中，通過宿主細胞的複製，這些DNA片段得到大量無性繁殖的克隆。這樣，每個宿主細胞實際上都包含了一段特定DNA的多個複製。這種技術特別有用，因為單個基因組DNA分子非常大且複雜，直接測序非常困難。通過將DNA切割成小片段並大量複製，可以更容易地分析和測序這些片段。