種子萌發是指種子在適宜的條件下，從吸水開始的一系列生理和形態變化過程，最終導致胚根突破種皮並形成幼苗。
種子萌發過程中，首先需要種子吸水，這會導致種皮膨脹和軟化，便於氧氣進入種子內部並幫助二氧化碳排出。其次，種子在萌發過程中不斷進行呼吸作用，以獲取能量保證生命活動的正常進行。最後，適宜的溫度對於種子的萌發也是必要的，因為只有在適宜的溫度下，種子的營養物質分解和其他生理活動才能正常進行。
此外，種子萌發的前提是種子具有生活力並且解除了休眠狀態。在某些植物中，種子可能還需要完成後熟過程。通常以胚根突破種皮作為萌發的標誌。