變構酶，也稱為別構酶，是一種在生物化學過程中發揮關鍵作用的酶，其催化活性受到調節。
變構酶通常由多個亞基組成，這些亞基包括催化亞基和調節亞基，催化亞基負責與底物結合併進行催化作用，而調節亞基則與變構效應劑結合，負責調節酶的活性。變構酶的活性可以通過兩種主要機制進行調節：變構激活和變構抑制，變構激活指的是酶活性的增加，而變構抑制則導致酶活性的降低。
變構酶在生物體內維持代謝平衡和適應環境變化方面發揮著重要作用，例如，當體內某種代謝產物的濃度過高時，變構酶可以通過調節作用減少該代謝產物的生成，從而避免細胞中毒。