公司補繳社保的流程通常包括以下幾個步驟：
準備補繳資料：需要準備社會保險人員補繳申報表，加蓋公章的勞動契約複印件，補繳期間的員工原始工資表及會計憑證等。
提交補繳申請：向當地社保中心提出補繳申請，並填寫相應的補繳申報表。
確認補繳金額：社保局稽核科會對投訴進行初步審核，並開展調查工作，確認需要補繳的金額。
繳納補繳費用：單位需將個人和公司應承擔的部分資金轉賬到社保局的賬戶中，完成補繳手續。
辦理補繳手續：為員工辦理相應的補繳手續，確保社保賬戶的完整性。
需要注意的是，如果是因為單位未按規定繳納社保，員工可以通過投訴或解除勞動契約等方式維護自己的權益。如果是因為單位經營困難等原因無法及時繳納社保，可以申請緩繳社保費用，但緩繳期限最長不得超過六個月。如果長時間未繳納導致職工無法享受社保待遇，職工可以通過法律途徑要求單位賠償相應的損失。
此外，一般情況下，單位只能補繳2個月的社保，如果需要補繳更長時間，可能需要通過代理機構來操作。