冬瓜子的食用方法多種多樣，主要包括以下幾種：
清煮冬瓜子。挑選飽滿的冬瓜子，清洗乾淨後放入鍋中，加入適量清水，大火煮開後文火煮一個小時。可根據口味加入冰糖。
冬瓜子菊花茶。將冬瓜子、菊花清洗乾淨後放入鍋內，加入適量清水，大火煮開後文火煮8分鐘，關火後燜2分鐘即可飲用。也可加入冰糖。
冬瓜子胖大海茶。將冬瓜子、胖大海清洗乾淨後放入鍋內，加入適量清水，大火煮開後文火煮15分鐘，關火後燜2分鐘即可。
冬瓜子金銀花茶。將冬瓜子、金銀花清洗乾淨後放入砂鍋內，加入適量清水，大火煮開後文火煮29分鐘即可。
冬瓜子蒲公英茶。蒲公英具有清熱解毒、消腫散結、利尿通淋的功效。
炒食冬瓜子。將冬瓜子放入鍋內用小火翻炒至熟透即可食用，可加入適量調味品。
冬瓜籽研末。炒黃後研成細末，空腹時用米湯送服，可用於治療某些疾病。
冬瓜籽具有潤肺、化痰、消癰、利水等功效，對改善肺熱咳嗽、咳痰咯血、口乾 舌燥等症狀有一定作用。不過，冬瓜子的食用應在醫生指導下進行，以避免對健康造成不良影響。