千年庭院的故事有很多，比較受歡迎的有白馬寺庭院和觀音禪院。
白馬寺庭院位於河南省洛陽市，相傳始建於北魏時期，是中國最早的皇家寺院之一，也是佛教傳入中國後興建的第一座官辦寺院。這裡的“馬蹄印”傳說和“佛祖釋迦牟尼誕生之床”的傳說都為千年庭院增添了幾分神秘的色彩。
另外，觀音禪院又名清涼寺，坐落在河南省漯河市郾城區，始建於東晉孝武帝時期，距今已有1600多年。這裡不僅是一處佛教聖地，更是一個擁有千年歷史底蘊的庭院。
此外，杜甫草堂、應縣木塔、蘇州園林等也有著千年庭院的故事。這些故事有的是關於草堂的由來，有的是木塔建造的千年傳奇，有的是千年庭院裡文人墨客的故事。
總之，千年庭院見證了中國歷史的變遷和文化的傳承，也留下了許多美麗動人的故事。