南京三天旅遊攻略如下：
第一天：
南京總統府：中國近代建築遺存中規模最大、保存最完整的建築群，經歷多個歷史時期，最終形成今天的基本格局。分為中區、西區和東區，中區是建築群的主軸線，前半部分以中式為主，後半部分以西式居多。
夫子廟：被譽為「南京第一學府」，是明清兩代南京最重要的文化中心，有許多文人墨客留下的優美詩歌和文章。
老東門秦淮小吃群：具有濃厚的南京慢生活氛圍，這裡有原汁原味的街巷和小吃，是體驗南京風情的絕佳地點。
第二天：
玄武湖：江南地區最大的城內公園，也是中國最大的皇家園林湖泊，湖岸呈菱形，面積廣闊，是寧靜休閒的好去處。
明孝陵：明朝開國皇帝朱元璋和皇後馬氏的合葬墓，1961年被國務院公布為首批全國重點文物保護單位，2003年被列入《世界遺產名錄》。
棲霞山：位於棲霞區中部，素有「六朝勝跡」之稱，被譽為「金陵第一明秀山」，在明代被列為「金陵四十八景」之一。
第三天：
頤和路民國風貌區：這裡是南京民國建築風格的代表地區之一，可以感受到民國時期的建築風格和文化氛圍。
先鋒書店（五台山總店）：位於五台山附近，是南京著名的書店之一，可以體驗南京的文化氣息。
南京大屠殺遇難同胞紀念館：這裡是紀念南京大屠殺的歷史場所，可以深入了解歷史事件。
南京濱江公園：位於長江邊，是南京的重要綠地之一，可以欣賞到長江的美景。
南京眼：夜晚的南京眼是南京的地標之一，可以俯瞰南京的美景。
以上行程涵蓋了南京的歷史、文化、自然風光等多個方面，可以讓遊客全面了解南京的魅力。