烤南瓜子的方法有多種，以下是幾種常見的做法：
直接烤制。首先，將南瓜子清洗乾淨，並徹底晾乾，可以直接在烤箱中烤制，預熱烤箱至350°F（約177°C），將南瓜子平鋪在烤盤上，烤12到15分鐘，直到南瓜子變脆，冷卻後即可食用。
醃製後烤制。首先，將南瓜子清洗乾淨並晾乾，然後將南瓜子與橄欖油、鹽、五香粉等調料混合，醃製一晚，之後將調料後的南瓜子晾乾，放入預熱至400°F（約204°C）的烤箱中烤10到15分鐘，期間翻動一次以確保均勻受熱，直到南瓜子變成金黃色。
根據個人口味，還可以添加其他調料如黑胡椒、辣椒粉等，每種方法都能使南瓜子呈現出獨特的口感和風味。