南瓜生蛆的原因主要有以下幾點：
南瓜果實表面受損或開裂。這會吸引傳粉昆蟲和蛆蟲，導致它們在南瓜內部生長，破壞南瓜的質量和肉質。
南瓜採摘後儲存不當。例如存放時間過長或環境溫度、濕度不適宜，這會吸引蛆蟲進入南瓜內部生長。
南瓜種子或土壤中存在蟲卵。這些蟲卵孵化成蟲後，會在南瓜內部尋找合適的環境繁殖。
南瓜受到蟲害或病害。這也會引起南瓜內部出現蟲子。
此外，南瓜瓤裡面生蛆可能是因為存放時間過長或在存放過程中被南瓜子所污染，此時不建議繼續食用。食用被蛆蟲污染的南瓜可能會引起腹瀉、噁心、嘔吐等症狀，嚴重時甚至可能危及生命。