印度尼西亞的主要城市包括：
雅加達：印尼首都，東南亞第一大城市，世界著名的海港，經濟中心，以金融業為主。
萬隆：西爪哇省的首府，被譽為「爪哇的巴黎」，是印尼著名的旅遊和避暑勝地。
日惹：印尼最有歷史的城市，爪哇文化的搖籃，擁有豐富的歷史遺蹟和文化遺產。
棉蘭：北蘇門答臘省的首府，重要的出入境口岸，紡織業、化工、建材和運輸工具領域發展迅速。
泗水：位於爪哇島東北沿海，印度尼西亞第二大海港，現代吸引力強。
望加錫：南蘇拉威西省的首府，蘇拉威西島上最大的城市，以貿易經濟為主。
坦格朗：雅加達西方25公里處，工業與製造業的中心，有超過1000座工廠。
勿加泗：位於爪哇島西部，依託極佳的地理位置和多樣的旅遊資源，促進了城市經濟穩步的增長。
三寶壟：位於爪哇島北岸，為中爪哇省的首府，為數眾多的華人聚居的印尼城市之一。
巨港：南蘇門答臘省首府，蘇門答臘島南部最大港口與貿易中心，有「水城」之稱。
以上城市構成了印度尼西亞的主要城市群，各自在經濟、文化、旅遊等方面發揮著重要作用。