反座子,也稱為反轉錄轉座子(retrotransposon),是一種由RNA介導轉座的轉座子元件,在結構和複製上與反轉錄病毒(retrovirus)類似,但沒有反轉錄病毒所需的env基因。反座子通過轉錄合成mRNA,再通過逆轉錄合成新的元件並整合到基因組中完成轉座,每轉座一次,其拷貝數就會增加一份。
反座子在許多真核生物中是一類數量較大的可活動遺傳成分,尤其在植物中更為豐富,是核DNA的主要組成部分。例如,玉米的基因組中有49~78%是反轉錄轉座子,而在小麥中這一比例高達約90%,在哺乳動物中,幾乎有一半的基因組(45%至48%)包含轉座子或殘餘轉座子,人類基因組大約有42%是反轉錄轉座子。
反座子可以分成兩大類,一類是特徵性結構反轉錄轉座子,這類反轉錄轉座子可以編碼反轉錄酶或整合酶,自主地進行轉錄,其轉座機制與反轉錄病毒相似,但不能像反轉錄病毒那樣以自由感染的方式進行傳播。另一類是非LTR反轉錄轉座子,包括LINE(長散在核重複序列)類、SINE(短散在核重複序列)類、複合SINE轉座子類,它們沒有長末端重複序列(non-LTR),自身也沒有轉座酶或整合酶的編碼能力,需要在細胞內已有的酶系統作用下進行轉座。
所有反轉錄轉座子都有一個共同特點,就是在其插入位點上產生短的正向重複序列。