《叛道武士》是一款提供了多種結局路徑的遊戲，根據不同的遊戲選擇和條件，玩家可以體驗不同的故事結局。遊戲中的攻略包括：
鬼燈線。贏得不死之山的最終戰鬥而不敗北；不滿足純愛END的條件且YL值為A；觸髮結局「思うままに自由気ままに」（隨心所欲）；贏得不死之山的最終戰鬥，不滿足YL值為A、不滿足純愛END條件且不是處女，觸髮結局「これからの大和」（今後的大和）；贏得不死之山的最終戰鬥，保持處女之身或滿足純愛END條件，觸發不同分支結局。處結局需保持處女之身，而純愛結局則無需保持。純愛END的條件為在第五章「激戰後の夜に結はれて」（在激戰後的夜晚結合）任務完成。非處結局「大切な人とに歩み続ける未來」（與重要的人一起走下去的未來）。
白夜線。贏得不死之山的最終戰鬥而不敗北；滿足YL值為A的條件，觸髮結局「私はもうサムライしゃない」（我不再是武士了）；贏得最終戰鬥且滿足惡墮值為3級，觸髮結局「人斬り無黑」（劊子手無黑）；贏得最終戰鬥且女主沒有達到YL值A與惡墮3級，觸髮結局「大和の夜明け」（大和的黎明）。
浪人線。贏得最終戰鬥且惡墮值為3級，觸髮結局「大和の支配者」；贏得最終戰鬥且三個女主的YL值為A，觸髮結局「工ロティックスローライフ」（工口的悠閒生活）；贏得最終戰鬥，觸髮結局「自由を手にした3人の女浪人」（獲得自由的三個女浪人）。