向日葵根腐病是由多種因素引起的，包括水分管理不當、施肥不當和病蟲害等，以下是詳細介紹：
水分管理不當。如澆水過多或忽乾忽濕，會導致土壤積水，影響根部呼吸和生長，從而引發爛根，因此，在養殖向日葵時，應避免過度澆水，並在發現積水時及時鬆土、排水。
施肥不當。如使用濃肥或生肥，可能會傷害根部，導致爛根，為了避免這種情況，應使用酵素菌漚制的堆肥或充分腐熟的有機肥，並注意適量施用化肥，防止土壤酸化。
病蟲害。也是導致向日葵爛根的一個重要因素，在病蟲害發生時，應及時噴灑相應的藥劑進行治療，並對爛根部分進行修剪。
此外，一些特定的病原菌，如瓜類腐皮鐮孢菌和Rhizoctonia solani AG2-2菌絲融合群，也能引起向日葵根腐病，在發現病害時，除了及時拔除病株並用石灰或藥劑消毒病穴外，還可以在發病初期使用特定的殺菌劑如多菌靈可濕性粉劑或立枯淨可濕性粉劑等進行防治。