多肽的分子量通常低於10,000Da（道爾頓），這一範圍涵蓋了由三個或三個以上胺基酸組成的肽類。多肽的分子量可以根據其胺基酸組成進行計算，計算公式為：多肽的分子量=胺基酸分子量之和-18*(n-1)，其中n為胺基酸的數量。例如，一個由10個胺基酸構成的多肽，其分子量計算方式為：十個胺基酸的分子量之和-18*9，因為形成這個多肽會生成9個肽鍵和9個水分子。
不同類型的多肽有不同的分子量範圍，例如：
寡肽（小分子肽）的分子量通常低於1000Da。
膠原蛋白多肽的分子量大約在1000到3000Da之間。
分子量在1000到5000Da之間的肽被稱為多肽。
此外，蛋白質有時也被稱為多肽，尤其是當它們由50個以上的胺基酸組成時。