天然氨基酸的種類有很多，包括甘氨酸、丙氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、甲硫氨酸（蛋氨酸）、脯氨酸、色氨酸、絲氨酸、酪氨酸、半胱氨酸、苯丙氨酸、天門冬酰胺、谷氨醯胺、蘇氨酸、天冬氨酸、穀氨酸、賴氨酸、精氨酸和組氨酸等。
這些氨基酸是構成蛋白質的基本單位，同時也是生物體內進行蛋白質修飾和合成的基礎。此外，還有一些衍生自這些基本氨基酸的氨基酸，如羥脯氨酸和羥賴氨酸，以及在某些生物體中發現的D-型氨基酸。人體內還有八種必需氨基酸，包括賴氨酸、蘇氨酸、纈氨酸、亮氨酸、異亮氨酸、色氨酸、苯丙氨酸和蛋氨酸，這些必需氨基酸不能由人體自身合成，需要通過食物攝入。