奶瓶消毒器清洗的步驟如下：
準備工具和清潔劑。需要寶寶餵養用品如洗盆、不鏽鋼盆或矽膠盆，奶瓶專用清潔劑，奶瓶專用清潔刷（不鏽鋼或矽膠），奶瓶消毒烘乾器。
拆卸配件。將奶瓶及吸奶器的所有配件完全拆卸，放入洗盆中，確保每個部件能單獨清洗，例如奶嘴要從瓶蓋處拆下，吸奶器的防溢乳矽膠膜要從連線器上拆下，吸奶器的導管在有髒污或殘留乳汁時才需要清洗。
清洗。在洗盆中加水，倒入奶瓶清洗劑，用熱水浸泡片刻，使用奶瓶刷清洗瓶身、瓶蓋和螺旋等，用奶嘴刷清洗奶嘴和矽膠部件，清洗排氣孔，然後用流動清水沖洗乾淨。
消毒與烘乾。使用奶瓶消毒烘乾器，選擇合適的消毒和烘乾功能和時間，消毒烘乾機下層放奶瓶等大件，上層放奶嘴、吸奶器的吸乳護罩、矽膠勺等。
無菌收納。消毒後的奶瓶和配件應妥善存放，以保持無菌狀態。
此外，定期清潔和消毒奶瓶消毒器本身也很重要，可以使用肥皂和溫水手工清洗，或者用洗碗機設定消毒模式來進行清洗。清洗後應確保設備完全乾燥，避免黴菌生長。