使用Endnote的主要流程包括下載和安裝、創建個人數據庫、導入文獻、編輯和管理文獻，以及插入參考文獻到Word中。以下是詳細介紹：
下載和安裝。從網上找到Endnote的最新版本並下載安裝，安裝完成後，Endnote通常會與Word集成。
創建個人數據庫。在Endnote中點擊“File”菜單，選擇“New”創建一箇新的數據庫，輸入數據庫名稱並選擇存儲位置。
導入文獻。可以從Web of Science、Pubmed、Google Scholar等網站搜索文獻，選擇需要的文獻並進行導出（選擇Endnote格式），然後這些文獻會被導入到Endnote數據庫中；也可以從本地文件夾導入PDF格式的文獻，需要確保文獻有Digital Object Identifier (DIO)號並且聯網。
編輯和管理文獻。Endnote提供了豐富的文獻管理功能，如創建分組、編輯文獻信息、閱讀PDF文獻等。
插入參考文獻到Word中。在Word中需要插入參考文獻的位置，選擇“Go to Endnote”並從Endnote中選擇要插入的文獻，然後返回Word中完成插入。
此外，Endnote還允許用戶自定義輸出樣式，修改參考文獻的格式以適應不同的出版要求，還可以對文獻進行標記、添加摘要和關鍵詞等操作。