除藻有多種方法，可以根據具體情況選擇合適的方式：
增加二氧化碳用量或投放二氧化碳片。可以提高水中的二氧化碳濃度，抑制藻類的生長，但需注意投放量，過多可能導致缸中生物缺氧。
引入會喫藻類的生物。如小精靈、異型、金線飛狐、黑殼蝦、大和藻蝦、紅鼻槍蝦、蘋果螺、黑金剛螺等，它們可以清理缸壁及大葉形水草的葉片。但需注意，這些生物可能增加污染源，長時間可能影響硝化系統。
手動去除。使用百潔布、卡片、刮刀等工具直接清理藻類。對於小面積的鋼毛藻、絲藻等，也可以用牙刷或鑷子去除。
減少光照。通過減少光照時間或用黑布遮缸來減緩藻類的繁殖速度，但長時間這樣做可能影響缸內生物的生理時鐘。
使用除藻劑。市面上有專門的除藻劑，但需謹慎使用，因爲它們可能對水草和魚類有害。
物理方法。如刮缸（刮藻刀、磁力吸）、換水等。保持穩定的換水頻率有助於預防藻類滋生。
選擇除藻方法時，需考慮藻類的種類、魚缸環境及所含生物等因素。