寺院被稱爲叢林的原因主要有以下幾點：
“叢林”一詞的本義是指茂密的樹林。這個概念後來被引申到佛教中，用來指代僧侶聚集、修道的地方。
“叢林”在佛教中的使用，通常特指禪宗寺院。這是因爲禪宗寺院在佛教中有着嚴格的規矩和法度，就像叢林中草木不亂生亂長一樣。
“叢林”也象徵着規矩和修行。在《禪林寶訓》中有這樣的描述：“草不亂生曰叢，木不亂長曰林”，這寓意着寺院是一箇遵循規矩、修行悟道的地方。
此外，雖然“叢林”最初是由僧伽的概念衍生出來的，但並非所有寺院都可以稱爲叢林。在漢傳佛教中，“叢林”通常是指禪宗寺院，其他如教、律等各宗寺院雖然有時也仿照禪林制度而稱叢林，但“叢林”仍以禪宗寺院爲主。