底砂清洗是維護魚缸水質和清潔度的重要步驟。以下是一些常見的底砂清洗方法：
生物過濾法。這種方法適用於養熱帶魚或小型觀賞魚。通過在魚缸底部鋪設濾材（如椰殼、陶粒等），利用過濾系統去除多餘的有機物和礦物質，從而保持水質乾淨，有利於魚兒健康生長。生物過濾法的核心是建立良好的硝化系統，通過微生物作用淨化水質。
物理過濾法。對於50厘米以上中大型魚缸，可以使用專門的換水器，如千銳的換水器，配合洗砂頭進行清洗。換水器利用虹吸原理，在換水時吸出魚缸中的水，同時帶走較輕的魚片和雜質，而較重的沙子則沉澱下來。一些換水器模型，如S系列，設計有固定旋鈕，可以將進水管固定在魚缸玻璃上，方便操作。
此外，對於小型的魚缸，可以使用小型魚缸換水器，通過吸力將魚片和少量髒沙子一起吸出，然後倒掉。如果長時間使用後感覺沙子量減少，可以適時添加新沙子。