施工縫的存在會對工程結構造成一定的危害。具體來說：
施工縫位置不當或處理不好可能會導致結構受力性能降低，影響結構的整體性和耐久性，甚至危及工程安全。例如，在梁、板施工縫留在跨中1/3的範圍內，可能會形成貫穿裂縫，嚴重危及肋梁的正常使用。
施工縫處理不當可能會導致新舊混凝土之間形成分層，削弱新舊截面之間的粘結力，降低結構的承載能力。例如，柱、牆底面和頂部的水平表面上容易積存垃圾、雜物、泥沙等，如果處理不當，會使縫處本應結合密實的地方形成嚴重夾渣分層，成為更薄弱的環節。
對於較大的梁，由於配筋較多，堵頭插板支護不嚴，施工縫可能成為台階縫，伸出的舌尖部分成為薄弱環節。這類施工縫引起的裂縫在平台梁、板施工中多見。
牆、柱水平施工縫處理不當可能會導致施工縫表面上的泥砂和積水無法排除，使新舊混凝土之間形成分層。
綜上所述，施工縫如果設定不當或處理不好，會降低結構的受力性能和耐久性，影響結構的整體性，甚至危及工程安全。