日本被遣返的原因主要包括：
使用非留學簽證：除了留學簽證，不應使用其他類型的簽證進行留學。
通過不良機構留學：應避免通過性質以勞務為主或以務工為噱頭的機構去日本留學。
未註冊課程：如果學生沒有在學校註冊課程，可能會被「原機遣返」。
違反校紀：如果學生違反學校紀律，校方會根據嚴重程度進行處理，嚴重到開除的程度，將立即遣返。
學習許可過期：如果學習許可證到期後未續簽，將變成「黑戶」，一旦被發現，會被直接遣返。
違反法律：如果涉及違法行為，如幫朋友帶違禁品入境，一旦被發現，將面臨遣返。
以上原因都可能導致日本公民或外國人被遣返。在留學期間，應遵守當地的法律和學校規定，以避免不必要的痲煩和經濟損失。