朱古力慕斯蛋糕的做法主要包括蛋糕坯和慕斯液兩個部分。具體做法如下：
製作蛋糕坯。將蛋黃和蛋清分開，在碗中混合可可粉、玉米油和牛奶，攪拌均勻；過篩低筋麵粉（50克）到朱古力牛奶液中，攪拌至無乾粉狀態，然後分兩次加入蛋黃，攪拌均勻，形成朱古力蛋黃糊；在蛋白中加入檸檬汁和糖，打發至乾性狀態（提起打蛋頭能出現小尖鈎）；將三分之一打發好的蛋白霜倒入蛋黃糊中，翻拌均勻，然後倒入剩餘的蛋白霜中，繼續翻拌均勻；將蛋糕糊倒入模具中，從20厘米高度摔下排出氣泡，放入預熱好的烤箱中，上下火130度烤30分鐘，再轉150度烤20分鐘；烤好後摔下模具，倒扣放涼，切出兩片大小相同的蛋糕片備用。
製作慕斯液。將吉利丁泡軟在冷水中，軟化後的奶油乳酪加入細砂糖攪拌至順滑狀態；牛奶加熱後加入泡軟的吉利丁，煮至吉利丁融化，然後倒入乳酪糊中攪拌均勻；乳酪糊過篩一遍，使慕斯更細膩；朱古力隔熱水融化後，與打發至有紋路的淡奶油混合攪拌均勻；將朱古力的奶油液與乳酪糊混合拌勻；在模具中鋪一片蛋糕片，倒入一半慕斯液，放入冰櫃冷凍15分鐘；再鋪入第二片蛋糕片，倒入剩餘慕斯液，放入冰櫃冷藏四小時。
脫模和裝飾。凍好後用吹風機脫模，篩上可可粉作為裝飾。