在《名偵探柯南》中，有幾集被認為是較為恐怖的，其中包括：
第51集《圖書館殺人事件》：在這集中，少年偵探團在圖書館發現了一個恐怖的秘密，圖書館館長竟然是殺人犯，屍體被藏在電梯頂部，館長恐怖的面孔和詭異的配樂給觀眾留下了深刻的印象。
第35集《山莊繃帶怪人殺人事件》：這集講述小蘭和園子在山莊度假時遇到了繃帶怪人，犯人殺完人後殘忍地肢解了被害者，並將頭藏在衣服里偽裝成肚子，這個情節讓人印象深刻且毛骨悚然。
第146集《藍色古堡探索事件》：這集的故事發生在一個陰森的古堡中，充滿了恐怖和懸疑的元素，給觀眾留下了深刻的印象。
第296集《幽靈鬼屋的真相》：這集講述柯南、小五郎和小蘭到一間老舊陰森的房子裡過夜，晚間會自動變紅的馬桶水，從電視中冒出來的女鬼，廁所的窗戶外面出現的臉，這些情節都非常嚇人。
第110集《偷竊集團別墅時間》：雖然這一集在恐怖程度上可能不如其他幾集那麼突出，但它也是被列入最恐怖的五集之一。
此外，還有如第184集《詛咒假面的冷笑》和第222集《人魚失蹤記事件篇》等集數也被認為是比較恐怖的。這些集數中的殺人手法和場景往往給觀眾留下了深刻的印象，甚至在某些人心中留下了陰影。