植物酵素的服用方法因目的不同而有所區別。以下是一些常見的服用方法：
通用保健。早晚空腹服用，可緩解疲勞、提高免疫力。
亞健康人群。早晚空腹服用，午休後可增加一次。
疾病症狀改善。餐前30~60分鐘服用，每日1~2次。
減肥。餐前1小時或臨睡前半小時空腹服用，每天1~2次。
增肥。餐後半小時服用，每日1~2次。
解酒。飲酒前服用，可降低血液中的酒精濃度。
幫助消化。吃飯時或飯後服用。
清腸或改善便秘。空腹服用。
老年人服用。早晚空腹用，有助於維持機體正常功能。
此外，服用酵素時需注意水溫控制在40度以下，避免在強光、強酸、強鹼環境下久置。酵素不是藥品，需要長期使用才能見效。