沙漠水井主要有以下幾種用途：
提供飲用水源。在沙漠這種乾燥地區，自然形成的水井是一種珍貴的資源，可以為當地居民和旅行者提供飲用水。
農業灌溉。水井中的水還可以用於農業灌溉，支持當地的農業生產。
生態保護。水井有助於防止沙漠化擴大，改善當地環境質量。
旅遊和文化教育。在沙漠地區，水井可以成為旅遊景點，幫助遊客了解當地的文化和歷史。
日常生活和宗教用途。如印度階梯井，除了蓄水，還可以用於休息、舉行宗教儀式等。
此外，沙漠水井中的「無限水源」方塊可以讓使用者利用水桶無限取水。需要注意的是，沙漠水井並不意味著裡面或下面會有其他特別的物品或結構，它的主要功能就是提供水源。