河道治理的方法主要包括以下幾種：
物化方法：這種方法利用物理化學原理，通過電解、催化氧化、硝化分解等過程吸收污染水體中的有害物質。
生態濕地修復法：生態濕地具有降解污染物、淨化水質的功能。通過讓污染水體流過生態濕地，逐步降解污染物，提高水質標準。但這種方法需要較大的面積，且淨化效率相對較低。
調水方法：這種方法包括黑水掉水等，對某一城市區域是一個較為理想的方法，見效快，成本低。然而，調水並不是真正解決污染水體的方法，只是將污染水體從某一區域轉移到另一區域，即上游向下游的轉移。
生物—生態水體修復技術：這種方法主要是利用天然存在的微生物，在人為的乾涉下，增加微生物活性能力，通過微生物生命活動，將有機物轉化為無機物，逐步恢復水生生態系統，目標是恢復水體的自淨功能。
清淤疏浚工程：通過清理淤泥、垃圾，改善河道水環境，增加河道的洩洪能力。但需要注意不破壞河道原有的彎曲性，保留河道中的灘地、沙洲。
坡岸整治工程：根據河段的不同選擇合理的斷面設計，如斜坡式漿砌石生態護岸、斜坡式鵝卵石生態護岸、直立式漿砌石護岸和自然植被護岸等。
水系連通工程：通過完善河流排澇體系，使水流暢通，提高水系的防洪排澇功能。
親水、景觀綠化工程：為穩固河岸、防止水土流失、美化河岸景觀，進行綠化，並適當增加休閒平台、親水棧道等水邊設施。
曝氣復氧法：對於長期處於缺氧狀態的黑臭河流，曝氣復氧有助於加快水生態系統恢復到正常狀態的過程。