活性炭吸附塔的工作原理是利用活性炭的孔隙結構，通過吸附作用將廢氣中的有害物質濃度降低，並將這些物質固定在活性炭內部。
活性炭具有發達的空隙和較大的比表面積，因此具有很高的吸附能力。當廢氣通過活性炭層時，氣體中的污染物被活性炭表面的吸附劑吸引，從而被去除。這一過程稱為吸附。隨著活性炭吸附污染物飽和，其吸附能力會下降，此時需要對活性炭進行脫附處理，以恢復其吸附能力。脫附處理可以通過加熱或減壓的方式進行，使被吸附的污染物從活性炭的孔隙中解吸出來，並可進一步處理或排放。
活性炭吸附塔通常由活性炭層和承托層組成，內部填充有活性炭。廢氣通過風機動力進入塔體，經過活性炭層時，污染物被吸附，淨化後的空氣排出塔外。