根據提供的信息，新海誠動畫電影《鈴芽之旅》的地點主要包括：
宮崎縣日南市。這是鈴芽居住的小鎮，被稱為「九州小京都」，以其熱帶風情的海景著稱。
油津港。鈴芽和草太相遇的斜坡位於油津港附近，這個港口是宮崎縣的重要港口，歷史悠久，保留著古代的印記。
祇園踏切。這是電影中出現的平交道，其圍欄、警示以及周邊建築都被忠實還原。
湯平溫泉。鈴芽和草太尋找「門」的過程中經過的街道和房屋，仿照了湯平溫泉打造。
佐賀關港。鈴芽和草太出海追逐貓咪大臣的港口，仿照了從九州到四國的「九四橘子渡輪」外觀。
八幡濱港。鈴芽追逐大臣後著陸的地方，附近有電車站和摩天輪。
JR八幡浜站。這是電影中鈴芽和草太尋找大臣的起點。
此外，電影的地點還包括神戶市、東京、宮城縣大谷海岸等。這些地點涵蓋了從九州到東京的廣泛區域，每個地點都有其獨特的文化和自然景觀。