玻璃容器的清洗方法取決於容器的類型和所附著的物質。常見的清洗步驟包括：
初步清洗。使用自來水和毛刷或試管刷清洗容器內外，去除灰塵和可溶性物質。
使用洗滌劑。對於難以清洗的污漬，如油污或有機物質，可以使用洗滌劑。將洗滌劑與水配成適當比例的溶液，浸泡容器後再用毛刷或海綿清洗。
特殊處理。對於有特殊要求的玻璃器皿，如精密刻度的量器，應避免使用毛刷以免損傷刻度。可以使用專用清洗劑和機器進行清洗。
去污粉的使用。去污粉可以用於清洗玻璃器皿的外表面，但不宜用於內壁，以防刮傷玻璃。
高溫處理。某些情況下，如需要去除鉛或砷等重金屬，可以使用稀鹽酸或重鉻酸鉀溶液浸泡容器，然後用大量自來水沖洗。
最後處理。清洗後的玻璃器皿套用純水沖洗2至3次，確保沒有洗滌劑殘留。洗淨的玻璃器皿內外不掛水珠，且器壁上殘留的水用指示劑檢查為中性。
乾燥和儲存。洗淨的玻璃器皿應自然晾乾或用烤箱烘乾，並用油光紙或牛皮紙等包裝，防止再次污染。
每種玻璃器皿的清洗方法可能略有不同，因此具體操作時應參考器皿的使用說明或實驗室的規程。