瑤柱的保存方法有多種，可以根據需要保存的時間長短來選擇合適的保存方式：
短期保存。如果計劃在短時間內使用瑤柱，可以將清洗乾淨並晾乾水分的瑤柱用保鮮膜包裹後放入冰櫃保鮮層，這樣可以保存7天左右。
長期保存。若需長期保存瑤柱，在將其清洗乾淨並晾乾後，可以使用密封袋或保鮮袋將瑤柱密封，並放入冰櫃冷凍室，這種方法可以有效延長瑤柱的保存時間，至少可達一年以上。
特殊方法。一些特殊的方法，如使用真空保存可以隔絕空氣，防止腐敗和氧化，或者用烤箱進行脫水處理，這些方法適用於工廠進行大批量的加工。
無論哪種保存方法，都建議先選擇新鮮、無異味、無霉變的瑤柱，並儘量避免將瑤柱與異味物品一起存放。同時，定期檢查存儲的瑤柱，確保其品質未發生變化。