盆栽蔬菜施肥的方法主要包括底肥、種肥和追肥。
底肥：在種植或移栽前施用，常用的有機肥包括廚餘堆肥、雞糞、餅肥、商品有機肥等。這些肥料肥力較足，但用量不宜過多，一般占盆土的十分之一左右。在花盆底部墊一層土，然後將底肥放在上面，最後再蓋上土。
種肥：選擇腐熟乾燥的有機肥伴土作為種肥，與種子一起播種。注意肥料用量不宜過多，也可以使用發酵後的液體肥料浸種。
追肥：由於底肥在整個種植周期只用一次，光靠它的養分供給是遠遠不夠的。這時候就需要我們定期追肥。在幼苗期，不建議追肥，以免導致徒長。追肥時可以選擇固體肥，如餅肥、雞糞、草木灰、商品有機肥等，或者液體肥，如尿液發酵、淘米水、花生餅菜籽餅兌水漚肥等。
施肥的原則是寧稀勿濃，次數可以頻繁，但是濃度不要太大，以免燒傷葉子或根。此外，還可以使用酵素液、米醋、食用小蘇打等用水稀釋後噴灑蔬菜葉面。
需要注意的是，不同的蔬菜對肥料的要求不同，總體來說，盆栽蔬菜要採取薄肥勤施的方法，每兩周施肥一次即可。