私函和公函有本質的區別。私函通常討論個人私事，沒有特定的格式要求，也不需要標題。它們是私人之間的交流，可以使用多種表達方式，包括敘述、描寫、抒情、議論和說明，以及各種修辭方法。私函的結尾通常會使用祝辭。
相比之下，公函是正式的公務文書，用於公務活動之間的溝通。它們通常有特定的格式，包括文號、受文機關、秘密等級、公章落款等。公函的內容受到一定的限制，主要採用敘述式和說明式，而且在寫作中不宜使用多種修辭。公函的結尾一般不使用祝辭，而是使用公文格式套語。
公函在行文關係上是平行文，主要用於不相隸屬機關之間的商洽工作、詢問和答覆問題，或者向有關主管部門請求批準。公函可以分為幾種類型，包括便函、商洽函、問答函和請批函。便函採用書信格式，不擬檔案標題，只有上下款和日期。商洽函用於商量洽談辦理某一問題，問答函用於詢問或答覆某一事項，而請批函則用於請求批準某一事項。