聲調標註位置及規則如下：
標註位置：聲調符號要標在音節的韻母上，按a、o、e、i、u、ü的順序，優先選擇字母a，沒有a再找o、e，然後是i、u，若i、u並列則標在後。如果音節是單韻母，就直接標在這個韻母上。
標註規則：當需要往字母i上標聲調時，需將上面的點去掉後再標聲調；i、u同時出現時，需要把聲調標在後面的字母上；當音節上面沒有標註任何聲調時，說明這個音節需要讀輕聲；此外還要遵循「有a找a，沒a找oe，iu一起標在後」的順口溜。
漢語拼音中還存在一種特殊聲調，叫做輕聲，有時也叫做第五聲，在漢語拼音中不標調。比較常見的輕聲詞是「爸爸」「媽媽」等這類重疊形式的詞語，第二個字音節的聲調會標作輕聲。