使用自動擠牙膏器的方法主要分爲以下幾個步驟：
安裝固定架。根據安裝表面的材質（如玻璃、瓷磚等光滑表面），選擇使用雙面膠或螺絲固定架進行安裝。如果使用雙面膠，需要先清理安裝表面的灰塵；如果使用螺絲固定架，則需要在牆面打孔後安裝。
安裝擠牙膏器。將擠牙膏器的上下兩部分外殼拆開，把牙膏管口插入吸入閥中，然後將外殼合上。撕開背面的雙面膠，粘貼在之前準備的固定架上。
排出空氣。用手或牙刷按壓擠壓按鈕，排出真空閥內的空氣，直到牙膏被擠出。
擠牙膏。用牙刷適當推擠壓按鈕，根據牙刷推進的深度獲取適量的牙膏。
此外，自動擠牙膏器採用真空壓縮原理，無需電源或雙手操作，通過牙刷無接觸牙膏管口的方式保持衛生。