菩提根的清洗方法主要包括以下幾個步驟：
初步清理：使用乾淨的搓澡巾或粗毛巾包裹菩提根，每天揉搓約兩個小時，持續兩三天，以去除表面的蠟層、灰塵和污漬。
浸泡與清洗：將菩提根浸泡在清水中片刻，然後用軟毛刷輕輕刷洗，去除表面的灰塵和污漬，之後瀝乾水分。
去除瑕疵：使用細砂紙輕輕打磨菩提根表面，去除可能存在的瑕疵，如腐蝕、磨損等。
打磨與拋光：使用打磨工具（如砂紙、拋光輪、鋼絲刷）輕輕打磨菩提根，使其表面變得更加光滑。使用溫水清洗打磨後的菩提根，去除殘留物。
拋光：在菩提根表面塗上一層拋光膏，使用拋光輪均勻塗抹，輕輕按摩表面，直至達到所需的拋光效果。使用溫水清洗拋光後的菩提根。
晾乾：將菩提根放置在通風處晾乾，等待完全乾燥。
塗抹保護油：爲了保持菩提根的光澤和保護表面，建議在打磨和拋光完成後塗抹一層保護油。
需要注意的是，菩提根不宜長時間浸泡在水中，以免發生膨脹或開裂，且應避免接觸含有化學成分的物品。在盤玩過程中，應保持手部清潔，並在盤玩後清理珠子表面。