真菌類
蘑菇屬於真菌類生物，是真菌門擔子菌亞門層菌綱傘菌目生物的統稱。雖然蘑菇在烹飪中通常被當作蔬菜來對待，但從生物學分類的角度來看，蘑菇與蔬菜有着明顯的區別。真菌是和動物與植物並列的一箇生物類別，蘑菇不僅不是植物，甚至更接近於動物。更準確地說，人們見到的蘑菇只是真菌的“果實”，是已組織化了的菌絲體，學名“子實體”。
此外，蘑菇中的食用蘑菇大多數屬於擔子菌類，極少數屬子囊菌類。食用蘑菇廣泛分佈於地球各處，是理想的天然食品或多功能食品，如香菇、木耳、銀耳、猴頭、鬆口蘑、紅菇、牛肝菌、草菇、金針菇、竹蓀等。