蛋白質互補是指將兩種或兩種以上食物蛋白質混合食用，其中所含有的必需氨基酸取長補短，相互補充，達到較好的比例，從而提高蛋白質生物價的方式。
不同食物蛋白質中的必需氨基酸含量和比例不同，通過將不同種類的食物相互搭配，可以提高限制氨基酸的模式，由此提高食物蛋白質的營養價值。例如，玉米和小米單獨食用時，賴氨酸含量較低，蛋氨酸相對較高；而大豆中的蛋白質恰相反，混合食用時賴氨酸和蛋氨酸兩種氨基酸可相互補充。
爲充分發揮食物蛋白質互補作用，在調配膳食時應遵循三個原則：食物的生物學種屬愈遠愈好，搭配種類愈多愈好，品種越多，食用種類愈近愈好，同時食用最好。