生物體內
酶廣泛分布於生物體內，包括細胞內和細胞外。細胞內的酶主要參與新陳代謝過程，例如，光合作用的酶分布在葉綠體中，而呼吸作用的酶則分布在細胞質基質和線粒體中。此外，有些酶與細胞的各種膜結構結合在一起，或位於細胞內其他結構的特定位置上，這些酶被稱為胞內酶。
細胞外的酶包括消化道的酶，如唾液澱粉酶、胃蛋白酶和胰蛋白酶等。這些酶在特定的細胞外環境中發揮作用，例如唾液澱粉酶在唾液中起作用。
酶的合成主要發生在細胞中，特別是在核糖體上合成蛋白質酶，隨後可能經過內質網和高爾基體的加工包裝。
總之，幾乎每個地方都有酶的存在，不單純局限於細胞器。