雲南的木瓜有多種吃法，以下是兩種常見的做法：
酸木瓜炒牛肉。這是一種受歡迎的家常菜做法。首先準備新鮮的酸木瓜，削去外皮後切成絲，同時準備牛肉也切成絲，用蔥薑汁、生抽、胡椒粉、玉米澱粉和清油醃製10分鐘。然後準備小米辣、蒜片、薑絲和小蔥段。在油鍋中炒熟牛肉後盛出。再在另一鍋中炒香小米辣、薑絲和蒜片，加入酸木瓜翻炒，然後迅速加入牛肉，加入適量的白糖、食鹽和雞精調味，快速翻炒約1分鐘，最後加入蔥段拌勻即可。這道菜酸香開胃。
木瓜涼粉。這是一種傳統的甜品做法。首先用紗布包裹木瓜籽，在水中揉搓直到產生黏膩的津液，繼續揉搓直到不再產生黏液，然後將混有木瓜籽津液的水放置幾個小時，讓木瓜水凝結成涼粉狀的固體。最後將其澆上糖水、芝麻粒和玫瑰花碎即可食用。