西北高、東南低
香格里拉的地形總趨勢是西北高、東南低。最高點巴拉格宗的海拔為5545米,最低點洛吉吉函的海拔為1503米,海拔高差為4042米,平均海拔為3459米。縣境地貌按形態可分為山地、高原、盆地、河谷。香格里拉地處青藏高原東南緣橫斷山脈三江縱谷區東部,沙魯里山脈由四川甘孜入縣境,分兩支將縣境東西兩側包圍,金沙江從土照壁進入縣境,南流至金江鄉撒蘇碧與麗江石鼓之間,突轉向東北,至洛吉吉函流入四川坪子了境,將縣境南部包圍。香格里拉的地形結構複雜,各種氣候類型相嵌交錯,同一氣候垂直帶內又有森林氣候,草原氣候,湖盆氣候等單個小地形氣候,形成「隔里不同天」的氣候特徵。