高能磷酸化合物包括多種化學物質，主要分爲以下幾類：
核苷酸及其衍生物。如ATP（腺苷酸）、GTP（鳥苷酸）、CTP（胞苷酸）、UTP（尿苷酸），這些是生物體內重要的能量攜帶者，其中ATP是最重要的。
磷酸肌酸。這是一種在肌肉和神經組織中發現的化合物，作爲能量儲存的一種形式。
烯醇磷酸。例如磷酸烯醇式丙酮酸，這類化合物含有高能磷酸鍵，水解時釋放大量能量。
其他磷酸化合物。包括焦磷酸、乙酰磷酸、1,3-二磷酸甘油酸等，這些化合物在生物體內參與多種生化過程。
這些化合物的一箇共同特點是含有高能磷酸鍵，這些鍵在斷裂時釋放大量能量，從而驅動生物體內的多種反應。