高速公路收費站通常根據車型、座位數、覈定荷載以及行駛里程等因素來收費。具體收費方式包括：
按車型收費。客車按照座位數分類，貨車則按覈定荷載分類，不同類型的車輛有不同的收費標準，例如，小型車（2噸含2噸以下貨車、20座以下客車）每公里0.45元；中型車（2噸以上至7噸含7噸貨車、21座以上至50座客車）每公里0.90元；大型車（7噸以上至20噸含20噸）每公里1.462元；特大型車（20噸以上貨車、集裝箱車）每公里2.138元。
計重收費。對於貨車，除了按車型分類外，還會根據載貨量進行差異化收費。
特殊橋樑收費。某些特殊橋樑可能會單獨計費，每車每次收費。
電子收費(ETC)。安裝ETC設備的車輛在進站和出站時，通過特定的電子收費門架自動扣費，這些費用通常由車主預先在銀行或高速公路管理部門辦理。
人工收費。車輛在進站和出站時需停在收費亭前，由收費員收取現金或刷卡過卡。
需要注意的是，不同省份的高速公路收費標準和方式可能存在差異，因此在進入高速公路前，可以查詢相關的收費信息。此外，某些特定車輛如軍隊車輛、武警部隊車輛、特定警車以及執行搶險救災任務的車輛可能免交通行費。