魚腸炎的治療方法根據不同的原因有所區別。以下是幾種常見類型及其治療方法：
內寄生蟲引起的腸炎。症狀可能包括身體消瘦、黑眼圈、拒食、空心白便或分段白便。治療方法包括換水（三分之一），停食，使用甲硝唑（例如，第一天，每百升水用6~8片；第二天，每百升水用3~4片），或者使用專門的魚藥，如“六鞭殺手”。
細菌性腸炎。通常由缸內細菌引起，症狀可能包括膿樣白便、趴缸、腹漲。治療方法包括換水（三分之一），提高水溫至28~30度，停食，使用廣譜腸炎魚藥，如“腸炎王”。
消化不良引起的腸炎。通常由過多或不乾淨的餵食引起，症狀可能包括灰白相間或膿樣白便、趴缸。治療方法包括停食，換水（三分之一），使用廣譜腸炎魚藥，如“腸炎王”。
對於不同類型的腸炎，可能需要不同的治療方法。重要的是要觀察魚的其它症狀（如食慾、體色、行爲等）來準確判斷病因，並採取相應的治療措施。在治療過程中，定期更換水並監控水質是非常重要的。如果情況嚴重或不確定病因，建議諮詢專業的水族館或獸醫。