黑潮中生活着多種魚類，包括但不限於以下幾種：
黑潮眶燈魚（學名：Diaphus kuroshio），這是一種輻鰭魚綱燈籠魚目燈籠魚科的動物，主要分佈於西北太平洋的日本海域，屬於深海魚類。
黑鮪魚，這是一種洄游性魚類，每年春夏之間會出現在中國臺灣東側的海域。
鮭魚、狹鱈、太平洋鯡魚、遠東擬沙丁魚、秋刀魚等，這些魚類也是洄游性魚類，主要產自黑潮所在的漁場。
烏魚，這是另一種通過黑潮直接游來的洄游性魚類。
大黃魚、小黃魚、帶魚、鮐魚、鯧魚、鰳魚、納魚、馬鮫魚、青魚、鰻魚、馬面鈍、蝶魚、石斑魚、金槍魚以及墨魚（烏賊）等，這些是黑潮中主要的經濟魚類，其中大黃魚和小黃魚在中國被稱爲“中國四大海產”。
鯨魚、鯊魚、鮁魚、刀魚、華魚（又叫老闆魚）、鱸魚（又叫歡魚）、洋魚、牙片魚、梭魚、銅鑼魚（又叫黃姑魚）等大型魚類，以及青皮魚、大頭寶魚、青皮藍、麪條魚、叫姑魚、油扣魚、尖嘴魚、靖魚、河豚魚（又叫青目鼓魚）等小型魚類，還有黃花魚、林刀魚、胖頭魚、青魚、光棍辮魚、鯽魚、小嘴魚、長脖魚、石江魚、黃魚（又叫黃敏子魚）、白敏魚、比目魚（又叫塔嘛魚）、鯧魚、針亮魚（又叫棒魚）、鮟鱇魚（又稱海先生或者叫結疤魚）、紅娘子魚、紅鯛魚（又稱火力魚）、鱔魚、黑魚、大頭鱈魚、鯰魚（又叫黃狼魚），加吉魚等中型魚類。
這些魚類有的在水面上跑，有的在水中間遊，還有的在水底活動。