鼠尾草的花色豐富多樣，主要包括藍色、紫色、紅色、粉色、白色等。其中，藍紫色是鼠尾草最常見的花色，如『藍花鼠尾草』和『紫花鼠尾草』，這些品種的花朵顏色從淡紫到深紫不等，具有很好的觀賞價值。此外，還有一些特殊品種，如『烈焰紅唇』櫻桃鼠尾草的花色會從白色逐漸變為紅色，而『跳舞娃娃』櫻桃鼠尾草和『玫紅皇後』森林鼠尾草則呈現粉白色相間的花色。
鼠尾草的花色不僅限於單一顏色，還有如『超級一串紅鼠尾草』和『一串紅鼠尾草』這樣的雙色品種，以及『暗紅鼠尾草』的淡紅色和『黃花鼠尾草』的黃色品種。這些多樣化的花色使得鼠尾草成為了一種非常受歡迎的觀賞植物。