Outlook提供了兩種主要的加密方式：S/MIME加密和Microsoft 365訊息加密（信息許可權管理）。
S/MIME加密。這種方式需要發件人和收件人都擁有支持S/MIME標準的郵件應用程式，並且需要先將證書添加到計算機上的密鑰鏈，然後在Outlook中配置這個證書。
Microsoft 365訊息加密。這種方式需要發件人具有Office 365企業版E3許可證中的Microsoft 365郵件加密，這種方式主要用於保護電子郵件的隱私，確保只有擁有相應私鑰的收件人才能閱讀加密的郵件。
此外，Outlook還支持對電子郵件內容和附屬檔案進行加密，並添加數字簽名，這可以進一步驗證發件人的身份並保護郵件內容在傳輸過程中的安全。