PCR（聚合酶鏈反應，Polymerase Chain Reaction）的原理基於DNA的半保留複製機制，是一種在體外酶促合成特定核酸片段的方法。具體過程如下：
變性階段：將反應混合物加熱到95度左右，使DNA雙鏈解離成單鏈，這是為了暴露出引物結合位點。
退火階段：溫度降低至60度左右，此時引物根據鹼基互補配對原則與DNA單鏈上的特定序列結合。
延伸階段：溫度再次升高至72度，耐熱的DNA聚合酶（如Taq聚合酶）開始合成新的DNA鏈。
這三個步驟構成一個循環，通過多次重複這個過程，可以指數級地擴增特定的DNA片段。在每個循環中，目標DNA的數量翻倍，隨著循環次數的增加，目標序列的拷貝數迅速增加。PCR反應體系中通常包括模板DNA、引物、脫氧核苷酸底物、耐高溫的DNA聚合酶、緩衝液、鎂離子（Mg²+）以及純淨水。引物的設計是PCR反應特異性的關鍵因素，它們必須與目標DNA序列精確配對，以確保擴增的正確性和效率。