SSRI（選擇性五羥色胺再攝取抑製劑）類抗抑鬱藥常見的副作用包括胃腸道反應，如噁心、嘔吐、腹痛和腹瀉。這些藥物可能會影響食慾，導致食慾增加或減少。此外，它們還可能引起神經系統相關的副作用，包括頭痛、頭暈、緊張、嗜睡、多夢和疲勞。在性功能方面，SSRI可能導致勃起困難、射精延遲等性功能障礙，尤其是在男性中較為常見。
SSRI的不良反應通常較為輕微，並且包括口乾、震顫、失眠、焦慮等。偶爾可能會出現皮疹，少數情況下能誘發輕躁狂。值得注意的是，SSRI類藥物不宜與單胺氧化酶抑製劑（MAOI）合用，且對於有癲癇病史者、孕婦、哺乳期婦女應謹慎使用。在心血管疾病和糖尿病患者中，使用SSRI時也應該小心。
在服用SSRI藥物時，還應注意可能出現的撤藥反應，因此不建議突然大量停藥。雖然SSRI的副作用可能令人擔憂，但大多數患者實際上只經歷其中的一小部分副作用，且有些副作用是可以隨著時間適應減輕的。